軟件介紹
ImageJ是一款專(zhuān)業(yè)級(jí)別的圖形分析工具,具有非常強(qiáng)大的對(duì)比功能,可以對(duì)各種顯微鏡下照片進(jìn)行分析以及數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),在生物及醫(yī)學(xué)圖像分析中起到非常重要的作用,當(dāng)然只要需要圖像分析的領(lǐng)域,這款軟件都能發(fā)揮作用,歡迎網(wǎng)友前來(lái)下載使用。
軟件特色
1、可運(yùn)行于Microsoft Windows,Mac OS,Mac OS X,Linux,和Sharp Zaurus等多種平臺(tái)。
2、ImageJ官方免費(fèi)版能夠顯示,編輯,分析,處理,保存,打印8位,16位,32位的圖片。
3、支持絕大部分圖片格式,包括TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多種格式。
4、ImageJ支持圖像棧功能,即在一個(gè)窗口里以多線(xiàn)程的形式層疊多個(gè)圖像, 并行處理。
5、ImageJ可以進(jìn)行豐富的基本圖像操作, 比如縮放,旋轉(zhuǎn), 扭曲, 平滑處理外等。
6、能進(jìn)行圖片的區(qū)域和像素統(tǒng)計(jì), 間距角度計(jì)算, 能創(chuàng)建柱狀圖和剖面圖,進(jìn)行傅里葉變換。
7、ImageJ是一個(gè)開(kāi)放結(jié)構(gòu)的軟件,基于java的公共的圖像處理軟件, 支持用戶(hù)自定義插件和宏。
8、自帶編輯器, 并且導(dǎo)入了java的編譯器,實(shí)現(xiàn)了簡(jiǎn)單的IDE功能,用戶(hù)可直接進(jìn)行圖像處理。
使用方法
使用Multi-Point工具進(jìn)行計(jì)數(shù)
打開(kāi)ImageJ軟件,F(xiàn)ile,Open打開(kāi)待分析圖片:
點(diǎn)擊point工具,右擊,選擇Multi-Point工具,手動(dòng)點(diǎn)擊進(jìn)行計(jì)數(shù):
點(diǎn)擊Analyze–>Measure,可以看見(jiàn)此時(shí)計(jì)數(shù)數(shù)量為23個(gè),保存圖片即可。
Cell Counter進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù)
點(diǎn)擊Plugins–>Analyze–>Cell Counter,界面如下:
點(diǎn)擊Initialize,可以對(duì)不同類(lèi)型的細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù):
可以看見(jiàn)Type1、Type2、Type3計(jì)數(shù)結(jié)果分別為2、1、2個(gè)。本方法可以同時(shí)對(duì)不同類(lèi)型的細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。點(diǎn)擊Cell Counter中的Results就可以看見(jiàn)不同類(lèi)型細(xì)胞的數(shù)量。Cell Counter與Multi-Point手動(dòng)計(jì)數(shù)方法相比可對(duì)不同細(xì)胞類(lèi)型計(jì)數(shù)。
常規(guī)自動(dòng)計(jì)數(shù)過(guò)程
打開(kāi)ImageJ軟件,F(xiàn)ile –>Open打開(kāi)需要分析的圖片:
Image –> Type -> 8-bit (改為灰度圖像)
Image -> Adjust -> Threshold 調(diào)節(jié)閾值,紅色代表選中,使所有細(xì)胞核均被選中,Dapi圖中閾值為11-255 –> Apply
注:熒光圖片背景為黑色,需要勾選下面的Dark background,表示背景為黑色
Apply以后圖片為:
對(duì)于豆子圖片,閾值范圍為37-255->Apply
Apply后得到圖片為:
從上面Apply后的圖片可以看到很多細(xì)胞連在一起,細(xì)胞計(jì)數(shù)時(shí)需要將其分開(kāi)。
Process -> Binary -> watershed (分水嶺分割方法,將連在一起的細(xì)胞分開(kāi))
得到分割效果如下:
安裝方法
1、首先等待ImageJ軟件官方下載完成
2、使用壓縮軟件解壓文件
3、雙擊運(yùn)行“ImageJ.exe”開(kāi)始安裝
4、自定義安裝目錄后等待安裝完成后即可注冊(cè)登錄使用
- 精選留言 來(lái)自四川自貢電信用戶(hù) 發(fā)表于: 2023-5-6
- 感謝分享,正在尋找這個(gè).
- 精選留言 來(lái)自甘肅定西電信用戶(hù) 發(fā)表于: 2023-5-4
- 謝謝小編大大分享,支持一下。。。
- 精選留言 來(lái)自江蘇徐州移動(dòng)用戶(hù) 發(fā)表于: 2023-7-15
- 這個(gè)厲害了哈哈
- 精選留言 來(lái)自江蘇南京移動(dòng)用戶(hù) 發(fā)表于: 2023-12-5
- 已經(jīng)下載安裝成功了,這種國(guó)產(chǎn)軟件大多都挺很好用的
- 精選留言 來(lái)自北京電信用戶(hù) 發(fā)表于: 2023-9-17
- 已經(jīng)有很多年沒(méi)用它了,下載過(guò)來(lái)繼續(xù)用依然還是這么方便。